Protein–RNA interactions for Protein: H3BS89

TMEM178B, Transmembrane protein 178B, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM178BH3BS89 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TMEM178BH3BS89 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms