Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMEM200CA6NKL6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms