Protein–RNA interactions for Protein: A1L190

SYCE3, Synaptonemal complex central element protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE3A1L190 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SYCE3A1L190 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms