Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00312Q9Y6C7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms