Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
USP16Q9Y5T5 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms