Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
AFG3L2Q9Y4W6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms