Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
NRXN3Q9Y4C0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NRXN3Q9Y4C0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms