Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
THRAP3Q9Y2W1 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
THRAP3Q9Y2W1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms