Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RAB23Q9ULC3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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