Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RDH8Q9NYR8 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RDH8Q9NYR8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms