Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV58

RNF19A, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19A, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF19AQ9NV58 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RNF19AQ9NV58 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms