Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PKDREJQ9NTG1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms