Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PRDM8Q9NQV8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms