Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GOPCQ9HD26 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GOPCQ9HD26 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms