Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NRDE2Q9H7Z3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NRDE2Q9H7Z3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms