Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C11orf49Q9H6J7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C11orf49Q9H6J7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms