Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TDGF1-205ENST00000542931 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC004816.1-202ENST00000557691 629 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL360268.1-201ENST00000453870 765 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 IFNA13-202ENST00000610660 1539 ntAPPRIS P2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 HMGN1P6-201ENST00000438508 291 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC048382.1-201ENST00000542197 1018 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 TAS2R1-201ENST00000382492 1359 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 AC124947.1-201ENST00000552835 814 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SENP3Q9H4L4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CDY12P-201ENST00000440679 1015 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 MKRN1-211ENST00000480552 906 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AP000842.1-201ENST00000524467 698 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SENP3Q9H4L4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms