Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CDHR2Q9BYE9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CDHR2Q9BYE9 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms