Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
KDM5DQ9BY66 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDM5DQ9BY66 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms