Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYCP2Q9BX26 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYCP2Q9BX26 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms