Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PAGR1Q9BTK6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PAGR1Q9BTK6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms