Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSM1

PCGF1, Polycomb group RING finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF1Q9BSM1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PCGF1Q9BSM1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms