Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SLC39A3Q9BRY0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms