Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGIP1Q9BQI5 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms