Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PIK3R4Q99570 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PIK3R4Q99570 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms