Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PSMD1Q99460 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PSMD1Q99460 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms