Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 VN1R53P-201ENST00000429536 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
PHF12Q96QT6 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL390039.1-201ENST00000399148 611 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PHF12Q96QT6 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms