Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CHAMP1Q96JM3 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CHAMP1Q96JM3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms