Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
LRIG1Q96JA1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms