Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PHF3Q92576 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms