Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXU2

DNAAF4, Dynein assembly factor 4, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAAF4Q8WXU2 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DNAAF4Q8WXU2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DNAAF4Q8WXU2 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms