Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DCAF4Q8WV16 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DCAF4Q8WV16 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms