Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SH3RF3Q8TEJ3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms