Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SEMA6DQ8NFY4 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms