Protein–RNA interactions for Protein: Q8NET4

RTL9, Retrotransposon Gag-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL9Q8NET4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RTL9Q8NET4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RTL9Q8NET4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms