Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms