Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCG5

CHST4, Carbohydrate sulfotransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST4Q8NCG5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHST4Q8NCG5 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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