Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
C9orf106Q8NAJ2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms