Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHCHD4Q8N4Q1 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHCHD4Q8N4Q1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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