Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
LTBP4Q8N2S1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LTBP4Q8N2S1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms