Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4L9

PPP1R42, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 42, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R42Q7Z4L9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPP1R42Q7Z4L9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPP1R42Q7Z4L9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms