Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMC4Q7Z404 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms