Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTOP1Q7RTM1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OTOP1Q7RTM1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms