Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT62

BARGIN, Bargin, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARGINQ6ZT62 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
BARGINQ6ZT62 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
BARGINQ6ZT62 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms