Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZR52

ZNF493, Zinc finger protein 493, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF493Q6ZR52 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ZNF493Q6ZR52 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms