Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APOA5Q6Q788 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms