Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF7Q6Q0C0 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF7Q6Q0C0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms