Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CCSAPQ6IQ19 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms