Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PHYHD1Q5SRE7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PHYHD1Q5SRE7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms