Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDE5

SVEP1, Sushi, von Willebrand factor type A, EGF and pentraxin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 3,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVEP1Q4LDE5 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SVEP1Q4LDE5 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms